NGS: высокопроизводительное секвенирование

NGS: высокопроизводительное секвенирование

Bibliographic Details
Main Author:	Ребриков Д. В.
Other Authors:	Коростин Д. О., Шубина Е. С., Ильинский В. В., Ребрикова Д. В.
Summary:	Рассмотрены различные варианты и особенности современных методов определения структуры нуклеиновых кислот (методов секвенирования второго и третьего поколений). Описаны принципы наиболее популярных технологий высокопроизводительного секвенирования (NGS). Дана классификация высокопроизводительных методов секвенирования по нескольким параметрам. Приведены основные элементы первичного анализа данных масштабного секвенирования. Отдельные главы посвящены применению NGS для решения различных биологических задач: секвенирования прокариотических и эукариотических геномов и транскриптомов, метагеномного секвенирования, а также использованию NGS в медицинской практике. Для сотрудников генно-инженерных и медицинских диагностических лабораторий, а также для преподавателей и студентов, специализирующихся в области молекулярной биологии и биотехнологии. Книга из коллекции Лаборатория знаний - Биология
Published:	Москва, Лаборатория знаний, 2024
Edition:	6-е изд. (эл.)
Subjects:	методы определения последовательности нуклеиновых кислот секвенирование одиночных молекул днк технологии создания библиотек фрагментов днк очистка нуклеиновых кислот оценка концентрации нуклеиновых кислот разрушение днк оценка длин фрагментов днк присоединение адаптеров предварительная амплификация библиотеки отбор фракции фрагментов нужной длины мечение смешиваемых образцов специфичными адаптерами клональная амплификация фрагментов днк типы библиотек фрагментов днк коммерческие технологии высокопроизводительного секвенирования технология 454 life sciences компании roche технология solid компании life technologies thermo fisher scientific illumina genome analyser компании illumina платформы ion pgm и ion proton компании life technologies thermo fisher scientific платформа pacbio компании pacific biosciences платформа heliscope компании helicos biosciences оценка качества первичных данных сборка геномов de novo алгоритмы сборки аппаратные и биологические особенности данных ngs объединение контигов в скэффолды вариации в близкородственных геномах картирование прочтений при повторном секвенировании поиск однонуклеотидного полиморфизма поиск структурных вариаций аннотация обнаруженных вариаций предсказание функциональных и клинически значимых изменений белка локальные центры обработки данных ngs программное обеспечение для локального центра обработки данных ngs сетевые сервисы и простые решения для обработки данных ngs специализированные проекты по обработке данных ngs общие принципы планирования биологических экспериментов рандомизация в ngs повторности в ngs основные типы ошибок при секвенировании варианты применения ngs роль ngs в микробиологии секвенирование индивидуальных геномов и транскриптомов прокариот история секвенирования бактериальных геномов определение полной последовательности бактериального генома de novo анализ данных геномного секвенирования бактерий секвенирование транскриптома прокариот исследование микробных сообществ методами ngs очистка днк для метагеномных исследований анализ микробного сообщества секвенированием ампликонов метагеномное секвенирование биоинформатический анализ данных метагеномного секвенирования комбинированный алгоритм анализа таксономического состава сообщества сравнение метагеномов между собой метатранскриптом секвенирование геномов эукариот общие аспекты секвенирования сложных геномов секвенирование эукариотических геномов de novo повторное секвенирование фазирование при ресеквенировании диплоидных геномов секвенирование генома отдельной клетки применение ngs для исследования рнк секвенирование транскриптомов эукариот параметры методов целевого обогащения повышение концентрации определенных последовательностей в библиотеке для ngs таргетное секвенирование обогащение библиотеки фрагментов днк только на основе пцр обогащение библиотеки фрагментов днк при помощи гибридизации с пробой обогащение при помощи гибридизации в растворе с отбором методом пцр обогащение библиотеки белок-связывающими последовательностями хроматина генетическое тестирование с использованием ngs применение высокопроизводительного секвенирования в медицинской практике исследование патогенов и микробиома человека
Online Access:	https://e.lanbook.com/book/387620 https://e.lanbook.com/img/cover/book/387620.jpg
Format:	Electronic Book

Internet

https://e.lanbook.com/book/387620
https://e.lanbook.com/img/cover/book/387620.jpg